Buon giorno, Michele
nessuna meraviglia circa le differenti intensità del colore della sua ametista:
il quarzo é un cristallo birifrangente, quindi otticamente si comporta in modo diverso a seconda della direzione d'osservazione, e nel caso delle pietre di colore una delle direzioni (di solito) trasmette un colore più intenso (o più gradito) dell'altra.

E in fase di taglio di solito si sfrutta questa caratteristica per evidenziare colore e saturazione proprio all'osservazione attraverso la tavola, o la parte superiore di un cabochon.

Tenga anche presente che nei soggetti trasparenti, soprattutto quando il colore é meno intenso, lo spessore gioca un ruolo fondamentale:
per farle un esempio, provi a osservare una lastra di vetro di fronte e "di coltello", che le apparirà prima incolore, e poi decisamente colorata.